Protein–RNA interactions for Protein: P00480

OTC, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTCP00480 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTCP00480 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTCP00480 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTCP00480 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTCP00480 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTCP00480 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTCP00480 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTCP00480 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTCP00480 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTCP00480 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTCP00480 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTCP00480 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTCP00480 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTCP00480 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTCP00480 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
OTCP00480 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTCP00480 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTCP00480 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTCP00480 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTCP00480 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
OTCP00480 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTCP00480 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTCP00480 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
OTCP00480 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTCP00480 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTCP00480 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTCP00480 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTCP00480 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTCP00480 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTCP00480 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTCP00480 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTCP00480 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTCP00480 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTCP00480 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTCP00480 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
OTCP00480 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
OTCP00480 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
OTCP00480 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
OTCP00480 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTCP00480 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTCP00480 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTCP00480 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTCP00480 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTCP00480 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTCP00480 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTCP00480 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTCP00480 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTCP00480 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
OTCP00480 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTCP00480 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTCP00480 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTCP00480 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTCP00480 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTCP00480 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTCP00480 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTCP00480 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTCP00480 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTCP00480 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTCP00480 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
OTCP00480 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTCP00480 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTCP00480 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTCP00480 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTCP00480 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTCP00480 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
OTCP00480 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTCP00480 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTCP00480 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTCP00480 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTCP00480 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTCP00480 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
OTCP00480 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTCP00480 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTCP00480 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTCP00480 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTCP00480 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTCP00480 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTCP00480 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTCP00480 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTCP00480 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTCP00480 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTCP00480 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTCP00480 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTCP00480 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
OTCP00480 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTCP00480 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTCP00480 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTCP00480 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTCP00480 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTCP00480 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTCP00480 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTCP00480 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTCP00480 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTCP00480 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTCP00480 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTCP00480 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTCP00480 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTCP00480 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTCP00480 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTCP00480 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms