Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATG7O95352 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATG7O95352 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATG7O95352 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATG7O95352 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ATG7O95352 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATG7O95352 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATG7O95352 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATG7O95352 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ATG7O95352 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATG7O95352 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATG7O95352 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ATG7O95352 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATG7O95352 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATG7O95352 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATG7O95352 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATG7O95352 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATG7O95352 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATG7O95352 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATG7O95352 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATG7O95352 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ATG7O95352 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATG7O95352 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATG7O95352 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATG7O95352 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATG7O95352 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATG7O95352 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATG7O95352 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ATG7O95352 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATG7O95352 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATG7O95352 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATG7O95352 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATG7O95352 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ATG7O95352 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATG7O95352 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATG7O95352 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATG7O95352 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATG7O95352 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATG7O95352 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATG7O95352 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATG7O95352 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATG7O95352 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATG7O95352 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATG7O95352 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ATG7O95352 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATG7O95352 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATG7O95352 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATG7O95352 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATG7O95352 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ATG7O95352 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATG7O95352 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATG7O95352 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATG7O95352 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATG7O95352 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATG7O95352 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATG7O95352 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATG7O95352 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATG7O95352 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATG7O95352 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATG7O95352 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ATG7O95352 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ATG7O95352 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ATG7O95352 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ATG7O95352 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATG7O95352 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATG7O95352 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATG7O95352 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATG7O95352 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATG7O95352 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATG7O95352 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATG7O95352 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATG7O95352 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATG7O95352 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATG7O95352 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATG7O95352 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATG7O95352 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATG7O95352 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATG7O95352 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG7O95352 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG7O95352 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG7O95352 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG7O95352 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG7O95352 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG7O95352 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG7O95352 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG7O95352 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATG7O95352 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATG7O95352 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATG7O95352 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATG7O95352 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ATG7O95352 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATG7O95352 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATG7O95352 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATG7O95352 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATG7O95352 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ATG7O95352 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATG7O95352 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATG7O95352 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATG7O95352 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATG7O95352 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms