Protein–RNA interactions for Protein: O95274

LYPD3, Ly6/PLAUR domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYPD3O95274 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LYPD3O95274 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LYPD3O95274 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LYPD3O95274 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LYPD3O95274 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LYPD3O95274 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LYPD3O95274 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LYPD3O95274 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LYPD3O95274 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LYPD3O95274 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LYPD3O95274 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
LYPD3O95274 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LYPD3O95274 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LYPD3O95274 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LYPD3O95274 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LYPD3O95274 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LYPD3O95274 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LYPD3O95274 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LYPD3O95274 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LYPD3O95274 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LYPD3O95274 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LYPD3O95274 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LYPD3O95274 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LYPD3O95274 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LYPD3O95274 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LYPD3O95274 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LYPD3O95274 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LYPD3O95274 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LYPD3O95274 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LYPD3O95274 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LYPD3O95274 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LYPD3O95274 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LYPD3O95274 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LYPD3O95274 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LYPD3O95274 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LYPD3O95274 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LYPD3O95274 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LYPD3O95274 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LYPD3O95274 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LYPD3O95274 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LYPD3O95274 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LYPD3O95274 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LYPD3O95274 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LYPD3O95274 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LYPD3O95274 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LYPD3O95274 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LYPD3O95274 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LYPD3O95274 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LYPD3O95274 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LYPD3O95274 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LYPD3O95274 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LYPD3O95274 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LYPD3O95274 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LYPD3O95274 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LYPD3O95274 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LYPD3O95274 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LYPD3O95274 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LYPD3O95274 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LYPD3O95274 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LYPD3O95274 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LYPD3O95274 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LYPD3O95274 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LYPD3O95274 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LYPD3O95274 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
LYPD3O95274 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LYPD3O95274 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LYPD3O95274 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LYPD3O95274 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LYPD3O95274 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LYPD3O95274 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LYPD3O95274 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LYPD3O95274 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LYPD3O95274 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LYPD3O95274 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LYPD3O95274 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LYPD3O95274 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LYPD3O95274 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LYPD3O95274 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LYPD3O95274 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LYPD3O95274 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LYPD3O95274 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LYPD3O95274 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LYPD3O95274 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LYPD3O95274 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LYPD3O95274 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LYPD3O95274 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LYPD3O95274 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LYPD3O95274 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LYPD3O95274 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LYPD3O95274 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LYPD3O95274 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LYPD3O95274 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LYPD3O95274 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LYPD3O95274 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LYPD3O95274 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LYPD3O95274 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LYPD3O95274 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LYPD3O95274 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LYPD3O95274 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LYPD3O95274 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms