Protein–RNA interactions for Protein: O95104

SCAF4, Splicing factor, arginine/serine-rich 15, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF4O95104 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCAF4O95104 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCAF4O95104 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCAF4O95104 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCAF4O95104 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCAF4O95104 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCAF4O95104 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCAF4O95104 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCAF4O95104 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCAF4O95104 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCAF4O95104 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCAF4O95104 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCAF4O95104 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCAF4O95104 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCAF4O95104 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCAF4O95104 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCAF4O95104 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCAF4O95104 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCAF4O95104 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCAF4O95104 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCAF4O95104 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCAF4O95104 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCAF4O95104 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCAF4O95104 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCAF4O95104 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCAF4O95104 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCAF4O95104 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCAF4O95104 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCAF4O95104 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCAF4O95104 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCAF4O95104 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCAF4O95104 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SCAF4O95104 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCAF4O95104 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCAF4O95104 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCAF4O95104 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCAF4O95104 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCAF4O95104 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCAF4O95104 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCAF4O95104 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCAF4O95104 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCAF4O95104 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCAF4O95104 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCAF4O95104 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCAF4O95104 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCAF4O95104 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCAF4O95104 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCAF4O95104 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCAF4O95104 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCAF4O95104 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCAF4O95104 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCAF4O95104 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCAF4O95104 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCAF4O95104 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCAF4O95104 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCAF4O95104 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCAF4O95104 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCAF4O95104 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCAF4O95104 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCAF4O95104 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SCAF4O95104 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCAF4O95104 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCAF4O95104 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCAF4O95104 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCAF4O95104 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCAF4O95104 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCAF4O95104 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCAF4O95104 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCAF4O95104 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCAF4O95104 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCAF4O95104 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCAF4O95104 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCAF4O95104 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCAF4O95104 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCAF4O95104 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCAF4O95104 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCAF4O95104 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCAF4O95104 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCAF4O95104 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCAF4O95104 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCAF4O95104 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCAF4O95104 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCAF4O95104 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCAF4O95104 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCAF4O95104 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SCAF4O95104 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCAF4O95104 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCAF4O95104 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCAF4O95104 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCAF4O95104 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCAF4O95104 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCAF4O95104 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCAF4O95104 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCAF4O95104 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCAF4O95104 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCAF4O95104 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCAF4O95104 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCAF4O95104 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SCAF4O95104 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCAF4O95104 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms