Protein–RNA interactions for Protein: O75712

GJB3, Gap junction beta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB3O75712 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJB3O75712 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJB3O75712 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJB3O75712 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJB3O75712 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJB3O75712 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJB3O75712 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJB3O75712 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GJB3O75712 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJB3O75712 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GJB3O75712 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GJB3O75712 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJB3O75712 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJB3O75712 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJB3O75712 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GJB3O75712 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJB3O75712 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJB3O75712 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJB3O75712 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJB3O75712 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJB3O75712 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJB3O75712 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJB3O75712 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJB3O75712 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJB3O75712 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJB3O75712 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJB3O75712 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJB3O75712 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJB3O75712 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJB3O75712 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJB3O75712 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB3O75712 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB3O75712 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB3O75712 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB3O75712 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB3O75712 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB3O75712 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GJB3O75712 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJB3O75712 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJB3O75712 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJB3O75712 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJB3O75712 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJB3O75712 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJB3O75712 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJB3O75712 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJB3O75712 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJB3O75712 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJB3O75712 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJB3O75712 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJB3O75712 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJB3O75712 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJB3O75712 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJB3O75712 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GJB3O75712 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GJB3O75712 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJB3O75712 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJB3O75712 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJB3O75712 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJB3O75712 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GJB3O75712 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJB3O75712 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJB3O75712 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GJB3O75712 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJB3O75712 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJB3O75712 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJB3O75712 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJB3O75712 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJB3O75712 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJB3O75712 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJB3O75712 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJB3O75712 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB3O75712 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB3O75712 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB3O75712 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB3O75712 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB3O75712 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB3O75712 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB3O75712 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB3O75712 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB3O75712 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB3O75712 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB3O75712 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB3O75712 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB3O75712 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB3O75712 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB3O75712 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB3O75712 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB3O75712 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB3O75712 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB3O75712 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB3O75712 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB3O75712 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB3O75712 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB3O75712 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB3O75712 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB3O75712 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB3O75712 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB3O75712 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB3O75712 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB3O75712 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms