Protein–RNA interactions for Protein: O75607

NPM3, Nucleoplasmin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM3O75607 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NPM3O75607 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NPM3O75607 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NPM3O75607 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NPM3O75607 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NPM3O75607 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NPM3O75607 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NPM3O75607 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NPM3O75607 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NPM3O75607 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NPM3O75607 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NPM3O75607 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NPM3O75607 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NPM3O75607 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NPM3O75607 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NPM3O75607 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NPM3O75607 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NPM3O75607 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NPM3O75607 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NPM3O75607 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NPM3O75607 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NPM3O75607 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NPM3O75607 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NPM3O75607 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NPM3O75607 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NPM3O75607 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NPM3O75607 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NPM3O75607 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NPM3O75607 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NPM3O75607 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NPM3O75607 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NPM3O75607 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NPM3O75607 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NPM3O75607 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NPM3O75607 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NPM3O75607 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NPM3O75607 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NPM3O75607 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NPM3O75607 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NPM3O75607 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NPM3O75607 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NPM3O75607 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NPM3O75607 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NPM3O75607 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NPM3O75607 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NPM3O75607 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NPM3O75607 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NPM3O75607 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NPM3O75607 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NPM3O75607 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NPM3O75607 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NPM3O75607 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NPM3O75607 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NPM3O75607 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NPM3O75607 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NPM3O75607 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NPM3O75607 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NPM3O75607 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NPM3O75607 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NPM3O75607 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NPM3O75607 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NPM3O75607 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NPM3O75607 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NPM3O75607 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NPM3O75607 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NPM3O75607 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NPM3O75607 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NPM3O75607 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NPM3O75607 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NPM3O75607 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NPM3O75607 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NPM3O75607 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NPM3O75607 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NPM3O75607 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NPM3O75607 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NPM3O75607 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NPM3O75607 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NPM3O75607 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NPM3O75607 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NPM3O75607 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NPM3O75607 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NPM3O75607 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NPM3O75607 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NPM3O75607 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NPM3O75607 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NPM3O75607 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NPM3O75607 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NPM3O75607 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NPM3O75607 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NPM3O75607 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NPM3O75607 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
NPM3O75607 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
NPM3O75607 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NPM3O75607 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NPM3O75607 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NPM3O75607 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NPM3O75607 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NPM3O75607 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NPM3O75607 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NPM3O75607 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms