Protein–RNA interactions for Protein: O75531

BANF1, Barrier-to-autointegration factor, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BANF1O75531 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BANF1O75531 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BANF1O75531 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BANF1O75531 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BANF1O75531 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
BANF1O75531 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BANF1O75531 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BANF1O75531 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BANF1O75531 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BANF1O75531 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BANF1O75531 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BANF1O75531 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BANF1O75531 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BANF1O75531 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BANF1O75531 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BANF1O75531 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BANF1O75531 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BANF1O75531 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BANF1O75531 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BANF1O75531 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BANF1O75531 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BANF1O75531 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BANF1O75531 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BANF1O75531 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BANF1O75531 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BANF1O75531 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BANF1O75531 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BANF1O75531 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BANF1O75531 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
BANF1O75531 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BANF1O75531 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BANF1O75531 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BANF1O75531 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BANF1O75531 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
BANF1O75531 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BANF1O75531 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BANF1O75531 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BANF1O75531 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BANF1O75531 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BANF1O75531 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BANF1O75531 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BANF1O75531 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
BANF1O75531 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
BANF1O75531 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BANF1O75531 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BANF1O75531 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BANF1O75531 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BANF1O75531 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BANF1O75531 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BANF1O75531 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BANF1O75531 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BANF1O75531 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BANF1O75531 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BANF1O75531 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BANF1O75531 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BANF1O75531 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BANF1O75531 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
BANF1O75531 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
BANF1O75531 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BANF1O75531 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BANF1O75531 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BANF1O75531 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BANF1O75531 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BANF1O75531 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
BANF1O75531 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BANF1O75531 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BANF1O75531 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BANF1O75531 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BANF1O75531 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BANF1O75531 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BANF1O75531 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BANF1O75531 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BANF1O75531 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BANF1O75531 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
BANF1O75531 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BANF1O75531 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BANF1O75531 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BANF1O75531 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BANF1O75531 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BANF1O75531 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BANF1O75531 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BANF1O75531 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BANF1O75531 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BANF1O75531 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BANF1O75531 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BANF1O75531 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BANF1O75531 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BANF1O75531 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BANF1O75531 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BANF1O75531 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BANF1O75531 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BANF1O75531 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BANF1O75531 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BANF1O75531 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BANF1O75531 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BANF1O75531 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BANF1O75531 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BANF1O75531 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BANF1O75531 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BANF1O75531 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms