Protein–RNA interactions for Protein: O75427

LRCH4, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH4O75427 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRCH4O75427 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRCH4O75427 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LRCH4O75427 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRCH4O75427 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRCH4O75427 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRCH4O75427 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRCH4O75427 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRCH4O75427 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRCH4O75427 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRCH4O75427 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRCH4O75427 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRCH4O75427 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRCH4O75427 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
LRCH4O75427 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
LRCH4O75427 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRCH4O75427 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LRCH4O75427 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRCH4O75427 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRCH4O75427 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LRCH4O75427 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRCH4O75427 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRCH4O75427 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRCH4O75427 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRCH4O75427 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRCH4O75427 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRCH4O75427 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LRCH4O75427 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRCH4O75427 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRCH4O75427 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRCH4O75427 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRCH4O75427 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRCH4O75427 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRCH4O75427 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LRCH4O75427 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRCH4O75427 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRCH4O75427 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRCH4O75427 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRCH4O75427 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRCH4O75427 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRCH4O75427 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRCH4O75427 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRCH4O75427 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRCH4O75427 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRCH4O75427 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRCH4O75427 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRCH4O75427 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRCH4O75427 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRCH4O75427 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRCH4O75427 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRCH4O75427 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRCH4O75427 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRCH4O75427 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRCH4O75427 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LRCH4O75427 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LRCH4O75427 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRCH4O75427 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRCH4O75427 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRCH4O75427 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRCH4O75427 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRCH4O75427 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRCH4O75427 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRCH4O75427 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRCH4O75427 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRCH4O75427 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRCH4O75427 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRCH4O75427 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRCH4O75427 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRCH4O75427 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRCH4O75427 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRCH4O75427 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRCH4O75427 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRCH4O75427 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRCH4O75427 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRCH4O75427 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRCH4O75427 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRCH4O75427 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRCH4O75427 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRCH4O75427 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRCH4O75427 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRCH4O75427 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRCH4O75427 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRCH4O75427 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRCH4O75427 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRCH4O75427 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRCH4O75427 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRCH4O75427 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRCH4O75427 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRCH4O75427 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRCH4O75427 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRCH4O75427 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRCH4O75427 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRCH4O75427 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRCH4O75427 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRCH4O75427 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRCH4O75427 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRCH4O75427 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRCH4O75427 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRCH4O75427 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRCH4O75427 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms