Protein–RNA interactions for Protein: O60602

TLR5, Toll-like receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR5O60602 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TLR5O60602 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TLR5O60602 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TLR5O60602 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TLR5O60602 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TLR5O60602 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TLR5O60602 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TLR5O60602 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TLR5O60602 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TLR5O60602 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TLR5O60602 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TLR5O60602 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TLR5O60602 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TLR5O60602 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TLR5O60602 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TLR5O60602 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TLR5O60602 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TLR5O60602 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TLR5O60602 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TLR5O60602 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TLR5O60602 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TLR5O60602 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TLR5O60602 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TLR5O60602 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TLR5O60602 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TLR5O60602 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TLR5O60602 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TLR5O60602 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TLR5O60602 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TLR5O60602 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TLR5O60602 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TLR5O60602 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TLR5O60602 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TLR5O60602 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TLR5O60602 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TLR5O60602 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TLR5O60602 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TLR5O60602 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TLR5O60602 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TLR5O60602 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TLR5O60602 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TLR5O60602 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TLR5O60602 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TLR5O60602 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TLR5O60602 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TLR5O60602 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TLR5O60602 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TLR5O60602 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TLR5O60602 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TLR5O60602 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TLR5O60602 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TLR5O60602 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TLR5O60602 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TLR5O60602 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TLR5O60602 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TLR5O60602 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TLR5O60602 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TLR5O60602 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TLR5O60602 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TLR5O60602 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TLR5O60602 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TLR5O60602 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TLR5O60602 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TLR5O60602 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TLR5O60602 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TLR5O60602 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TLR5O60602 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TLR5O60602 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TLR5O60602 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TLR5O60602 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TLR5O60602 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TLR5O60602 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TLR5O60602 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TLR5O60602 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TLR5O60602 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TLR5O60602 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TLR5O60602 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TLR5O60602 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TLR5O60602 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TLR5O60602 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TLR5O60602 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TLR5O60602 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TLR5O60602 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TLR5O60602 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TLR5O60602 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TLR5O60602 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TLR5O60602 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TLR5O60602 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TLR5O60602 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TLR5O60602 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TLR5O60602 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TLR5O60602 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TLR5O60602 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TLR5O60602 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TLR5O60602 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TLR5O60602 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TLR5O60602 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TLR5O60602 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TLR5O60602 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TLR5O60602 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms