Protein–RNA interactions for Protein: O60568

PLOD3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD3O60568 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLOD3O60568 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLOD3O60568 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLOD3O60568 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLOD3O60568 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLOD3O60568 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLOD3O60568 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLOD3O60568 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLOD3O60568 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLOD3O60568 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PLOD3O60568 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLOD3O60568 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLOD3O60568 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLOD3O60568 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLOD3O60568 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLOD3O60568 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLOD3O60568 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLOD3O60568 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLOD3O60568 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLOD3O60568 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLOD3O60568 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLOD3O60568 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLOD3O60568 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLOD3O60568 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PLOD3O60568 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLOD3O60568 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLOD3O60568 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLOD3O60568 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLOD3O60568 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLOD3O60568 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLOD3O60568 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLOD3O60568 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLOD3O60568 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLOD3O60568 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLOD3O60568 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLOD3O60568 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLOD3O60568 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLOD3O60568 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLOD3O60568 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLOD3O60568 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLOD3O60568 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLOD3O60568 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLOD3O60568 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLOD3O60568 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLOD3O60568 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLOD3O60568 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLOD3O60568 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLOD3O60568 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLOD3O60568 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLOD3O60568 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLOD3O60568 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLOD3O60568 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLOD3O60568 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLOD3O60568 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLOD3O60568 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLOD3O60568 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLOD3O60568 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLOD3O60568 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLOD3O60568 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLOD3O60568 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLOD3O60568 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLOD3O60568 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLOD3O60568 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLOD3O60568 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLOD3O60568 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLOD3O60568 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLOD3O60568 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PLOD3O60568 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLOD3O60568 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLOD3O60568 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLOD3O60568 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLOD3O60568 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLOD3O60568 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLOD3O60568 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLOD3O60568 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLOD3O60568 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLOD3O60568 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLOD3O60568 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLOD3O60568 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLOD3O60568 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLOD3O60568 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLOD3O60568 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLOD3O60568 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLOD3O60568 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLOD3O60568 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLOD3O60568 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLOD3O60568 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLOD3O60568 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLOD3O60568 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLOD3O60568 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLOD3O60568 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLOD3O60568 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PLOD3O60568 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLOD3O60568 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLOD3O60568 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLOD3O60568 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLOD3O60568 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLOD3O60568 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLOD3O60568 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLOD3O60568 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms