Protein–RNA interactions for Protein: O60423

ATP8B3, Phospholipid-transporting ATPase IK, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B3O60423 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP8B3O60423 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP8B3O60423 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP8B3O60423 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP8B3O60423 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP8B3O60423 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP8B3O60423 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP8B3O60423 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP8B3O60423 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP8B3O60423 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP8B3O60423 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP8B3O60423 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP8B3O60423 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP8B3O60423 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP8B3O60423 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP8B3O60423 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP8B3O60423 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP8B3O60423 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP8B3O60423 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP8B3O60423 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP8B3O60423 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP8B3O60423 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP8B3O60423 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP8B3O60423 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP8B3O60423 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP8B3O60423 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP8B3O60423 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP8B3O60423 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP8B3O60423 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP8B3O60423 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP8B3O60423 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP8B3O60423 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP8B3O60423 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP8B3O60423 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP8B3O60423 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP8B3O60423 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP8B3O60423 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP8B3O60423 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP8B3O60423 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP8B3O60423 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP8B3O60423 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP8B3O60423 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP8B3O60423 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP8B3O60423 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP8B3O60423 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP8B3O60423 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP8B3O60423 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP8B3O60423 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP8B3O60423 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP8B3O60423 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP8B3O60423 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP8B3O60423 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP8B3O60423 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP8B3O60423 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP8B3O60423 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP8B3O60423 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP8B3O60423 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP8B3O60423 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP8B3O60423 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP8B3O60423 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP8B3O60423 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP8B3O60423 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP8B3O60423 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP8B3O60423 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP8B3O60423 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP8B3O60423 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP8B3O60423 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP8B3O60423 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP8B3O60423 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP8B3O60423 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP8B3O60423 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP8B3O60423 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP8B3O60423 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP8B3O60423 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP8B3O60423 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP8B3O60423 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP8B3O60423 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP8B3O60423 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP8B3O60423 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP8B3O60423 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP8B3O60423 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP8B3O60423 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP8B3O60423 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP8B3O60423 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP8B3O60423 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP8B3O60423 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP8B3O60423 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP8B3O60423 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP8B3O60423 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP8B3O60423 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP8B3O60423 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP8B3O60423 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP8B3O60423 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP8B3O60423 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP8B3O60423 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP8B3O60423 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP8B3O60423 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP8B3O60423 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP8B3O60423 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP8B3O60423 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms