Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CREB3O43889 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CREB3O43889 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CREB3O43889 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CREB3O43889 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CREB3O43889 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CREB3O43889 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CREB3O43889 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CREB3O43889 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CREB3O43889 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CREB3O43889 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CREB3O43889 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CREB3O43889 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CREB3O43889 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CREB3O43889 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CREB3O43889 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CREB3O43889 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CREB3O43889 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CREB3O43889 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CREB3O43889 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CREB3O43889 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CREB3O43889 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CREB3O43889 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CREB3O43889 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CREB3O43889 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CREB3O43889 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CREB3O43889 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CREB3O43889 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CREB3O43889 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CREB3O43889 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CREB3O43889 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CREB3O43889 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CREB3O43889 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CREB3O43889 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CREB3O43889 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CREB3O43889 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CREB3O43889 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CREB3O43889 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CREB3O43889 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CREB3O43889 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CREB3O43889 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CREB3O43889 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CREB3O43889 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CREB3O43889 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CREB3O43889 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CREB3O43889 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CREB3O43889 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CREB3O43889 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CREB3O43889 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CREB3O43889 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CREB3O43889 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CREB3O43889 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CREB3O43889 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CREB3O43889 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CREB3O43889 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CREB3O43889 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CREB3O43889 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
CREB3O43889 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CREB3O43889 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CREB3O43889 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CREB3O43889 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CREB3O43889 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CREB3O43889 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CREB3O43889 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CREB3O43889 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CREB3O43889 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CREB3O43889 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CREB3O43889 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CREB3O43889 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CREB3O43889 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CREB3O43889 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CREB3O43889 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CREB3O43889 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CREB3O43889 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CREB3O43889 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CREB3O43889 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CREB3O43889 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CREB3O43889 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CREB3O43889 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CREB3O43889 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CREB3O43889 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CREB3O43889 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CREB3O43889 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CREB3O43889 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CREB3O43889 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CREB3O43889 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CREB3O43889 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CREB3O43889 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CREB3O43889 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CREB3O43889 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CREB3O43889 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CREB3O43889 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CREB3O43889 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CREB3O43889 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CREB3O43889 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CREB3O43889 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CREB3O43889 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CREB3O43889 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CREB3O43889 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CREB3O43889 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms