Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ACTN4O43707 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ACTN4O43707 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ACTN4O43707 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ACTN4O43707 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ACTN4O43707 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ACTN4O43707 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ACTN4O43707 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ACTN4O43707 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ACTN4O43707 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ACTN4O43707 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ACTN4O43707 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ACTN4O43707 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ACTN4O43707 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ACTN4O43707 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ACTN4O43707 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ACTN4O43707 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ACTN4O43707 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ACTN4O43707 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ACTN4O43707 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ACTN4O43707 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ACTN4O43707 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ACTN4O43707 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ACTN4O43707 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ACTN4O43707 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ACTN4O43707 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ACTN4O43707 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ACTN4O43707 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ACTN4O43707 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ACTN4O43707 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ACTN4O43707 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ACTN4O43707 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ACTN4O43707 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ACTN4O43707 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ACTN4O43707 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACTN4O43707 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACTN4O43707 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACTN4O43707 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACTN4O43707 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACTN4O43707 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACTN4O43707 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACTN4O43707 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACTN4O43707 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACTN4O43707 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACTN4O43707 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACTN4O43707 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACTN4O43707 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACTN4O43707 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACTN4O43707 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACTN4O43707 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACTN4O43707 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACTN4O43707 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACTN4O43707 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACTN4O43707 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
ACTN4O43707 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ACTN4O43707 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ACTN4O43707 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ACTN4O43707 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ACTN4O43707 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ACTN4O43707 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ACTN4O43707 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ACTN4O43707 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACTN4O43707 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACTN4O43707 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACTN4O43707 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACTN4O43707 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ACTN4O43707 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACTN4O43707 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACTN4O43707 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACTN4O43707 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACTN4O43707 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACTN4O43707 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACTN4O43707 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACTN4O43707 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACTN4O43707 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACTN4O43707 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACTN4O43707 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACTN4O43707 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ACTN4O43707 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ACTN4O43707 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ACTN4O43707 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ACTN4O43707 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ACTN4O43707 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ACTN4O43707 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ACTN4O43707 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ACTN4O43707 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ACTN4O43707 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ACTN4O43707 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ACTN4O43707 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ACTN4O43707 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ACTN4O43707 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ACTN4O43707 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ACTN4O43707 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ACTN4O43707 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ACTN4O43707 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ACTN4O43707 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ACTN4O43707 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ACTN4O43707 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ACTN4O43707 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ACTN4O43707 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms