Protein–RNA interactions for Protein: O43424

GRID2, Glutamate receptor ionotropic, delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID2O43424 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRID2O43424 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRID2O43424 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRID2O43424 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRID2O43424 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRID2O43424 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GRID2O43424 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRID2O43424 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GRID2O43424 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRID2O43424 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRID2O43424 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRID2O43424 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRID2O43424 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GRID2O43424 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRID2O43424 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRID2O43424 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRID2O43424 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRID2O43424 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRID2O43424 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRID2O43424 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRID2O43424 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRID2O43424 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRID2O43424 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRID2O43424 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRID2O43424 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRID2O43424 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRID2O43424 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRID2O43424 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRID2O43424 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRID2O43424 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRID2O43424 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRID2O43424 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRID2O43424 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRID2O43424 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRID2O43424 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRID2O43424 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GRID2O43424 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GRID2O43424 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRID2O43424 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRID2O43424 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRID2O43424 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRID2O43424 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GRID2O43424 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRID2O43424 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRID2O43424 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRID2O43424 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRID2O43424 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GRID2O43424 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRID2O43424 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRID2O43424 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRID2O43424 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRID2O43424 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRID2O43424 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRID2O43424 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRID2O43424 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GRID2O43424 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRID2O43424 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRID2O43424 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRID2O43424 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRID2O43424 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRID2O43424 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRID2O43424 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRID2O43424 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GRID2O43424 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRID2O43424 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRID2O43424 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRID2O43424 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRID2O43424 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRID2O43424 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRID2O43424 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRID2O43424 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRID2O43424 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRID2O43424 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRID2O43424 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GRID2O43424 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRID2O43424 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRID2O43424 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRID2O43424 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRID2O43424 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRID2O43424 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRID2O43424 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRID2O43424 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRID2O43424 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GRID2O43424 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRID2O43424 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRID2O43424 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRID2O43424 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRID2O43424 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRID2O43424 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRID2O43424 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRID2O43424 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRID2O43424 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRID2O43424 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRID2O43424 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRID2O43424 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRID2O43424 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRID2O43424 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRID2O43424 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRID2O43424 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRID2O43424 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms