Protein–RNA interactions for Protein: O43237

DYNC1LI2, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI2O43237 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DYNC1LI2O43237 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DYNC1LI2O43237 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DYNC1LI2O43237 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DYNC1LI2O43237 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
DYNC1LI2O43237 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
DYNC1LI2O43237 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DYNC1LI2O43237 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DYNC1LI2O43237 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DYNC1LI2O43237 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DYNC1LI2O43237 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DYNC1LI2O43237 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DYNC1LI2O43237 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DYNC1LI2O43237 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
DYNC1LI2O43237 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DYNC1LI2O43237 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DYNC1LI2O43237 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DYNC1LI2O43237 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DYNC1LI2O43237 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DYNC1LI2O43237 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DYNC1LI2O43237 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DYNC1LI2O43237 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DYNC1LI2O43237 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DYNC1LI2O43237 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DYNC1LI2O43237 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DYNC1LI2O43237 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DYNC1LI2O43237 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DYNC1LI2O43237 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
DYNC1LI2O43237 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DYNC1LI2O43237 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DYNC1LI2O43237 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DYNC1LI2O43237 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DYNC1LI2O43237 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DYNC1LI2O43237 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DYNC1LI2O43237 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DYNC1LI2O43237 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
DYNC1LI2O43237 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DYNC1LI2O43237 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
DYNC1LI2O43237 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DYNC1LI2O43237 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DYNC1LI2O43237 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DYNC1LI2O43237 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DYNC1LI2O43237 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DYNC1LI2O43237 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DYNC1LI2O43237 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DYNC1LI2O43237 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DYNC1LI2O43237 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DYNC1LI2O43237 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DYNC1LI2O43237 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DYNC1LI2O43237 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DYNC1LI2O43237 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DYNC1LI2O43237 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DYNC1LI2O43237 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DYNC1LI2O43237 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DYNC1LI2O43237 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DYNC1LI2O43237 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DYNC1LI2O43237 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DYNC1LI2O43237 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DYNC1LI2O43237 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DYNC1LI2O43237 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DYNC1LI2O43237 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DYNC1LI2O43237 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DYNC1LI2O43237 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DYNC1LI2O43237 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
DYNC1LI2O43237 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DYNC1LI2O43237 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DYNC1LI2O43237 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DYNC1LI2O43237 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
DYNC1LI2O43237 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
DYNC1LI2O43237 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DYNC1LI2O43237 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DYNC1LI2O43237 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DYNC1LI2O43237 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DYNC1LI2O43237 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DYNC1LI2O43237 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DYNC1LI2O43237 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DYNC1LI2O43237 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DYNC1LI2O43237 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DYNC1LI2O43237 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DYNC1LI2O43237 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
DYNC1LI2O43237 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DYNC1LI2O43237 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DYNC1LI2O43237 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DYNC1LI2O43237 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DYNC1LI2O43237 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DYNC1LI2O43237 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DYNC1LI2O43237 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DYNC1LI2O43237 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DYNC1LI2O43237 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DYNC1LI2O43237 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DYNC1LI2O43237 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DYNC1LI2O43237 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DYNC1LI2O43237 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DYNC1LI2O43237 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DYNC1LI2O43237 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DYNC1LI2O43237 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DYNC1LI2O43237 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DYNC1LI2O43237 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DYNC1LI2O43237 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DYNC1LI2O43237 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms