Protein–RNA interactions for Protein: O43166

SIPA1L1, Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1L1O43166 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIPA1L1O43166 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIPA1L1O43166 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIPA1L1O43166 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIPA1L1O43166 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIPA1L1O43166 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIPA1L1O43166 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIPA1L1O43166 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIPA1L1O43166 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIPA1L1O43166 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SIPA1L1O43166 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIPA1L1O43166 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIPA1L1O43166 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIPA1L1O43166 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SIPA1L1O43166 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SIPA1L1O43166 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SIPA1L1O43166 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SIPA1L1O43166 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SIPA1L1O43166 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SIPA1L1O43166 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SIPA1L1O43166 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SIPA1L1O43166 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SIPA1L1O43166 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SIPA1L1O43166 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SIPA1L1O43166 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SIPA1L1O43166 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SIPA1L1O43166 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIPA1L1O43166 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIPA1L1O43166 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIPA1L1O43166 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIPA1L1O43166 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIPA1L1O43166 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIPA1L1O43166 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIPA1L1O43166 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIPA1L1O43166 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIPA1L1O43166 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SIPA1L1O43166 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIPA1L1O43166 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIPA1L1O43166 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SIPA1L1O43166 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SIPA1L1O43166 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SIPA1L1O43166 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SIPA1L1O43166 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SIPA1L1O43166 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SIPA1L1O43166 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SIPA1L1O43166 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SIPA1L1O43166 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SIPA1L1O43166 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SIPA1L1O43166 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SIPA1L1O43166 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SIPA1L1O43166 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SIPA1L1O43166 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SIPA1L1O43166 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIPA1L1O43166 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIPA1L1O43166 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIPA1L1O43166 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIPA1L1O43166 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIPA1L1O43166 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SIPA1L1O43166 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIPA1L1O43166 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIPA1L1O43166 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SIPA1L1O43166 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms