Protein–RNA interactions for Protein: O15551

CLDN3, Claudin-3, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3O15551 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CLDN3O15551 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLDN3O15551 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLDN3O15551 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLDN3O15551 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLDN3O15551 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLDN3O15551 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLDN3O15551 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CLDN3O15551 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLDN3O15551 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLDN3O15551 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLDN3O15551 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLDN3O15551 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLDN3O15551 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLDN3O15551 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLDN3O15551 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLDN3O15551 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CLDN3O15551 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLDN3O15551 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLDN3O15551 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CLDN3O15551 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLDN3O15551 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLDN3O15551 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLDN3O15551 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLDN3O15551 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLDN3O15551 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLDN3O15551 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLDN3O15551 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLDN3O15551 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLDN3O15551 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLDN3O15551 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLDN3O15551 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLDN3O15551 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLDN3O15551 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLDN3O15551 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLDN3O15551 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLDN3O15551 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLDN3O15551 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLDN3O15551 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLDN3O15551 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLDN3O15551 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLDN3O15551 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLDN3O15551 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLDN3O15551 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLDN3O15551 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLDN3O15551 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLDN3O15551 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CLDN3O15551 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLDN3O15551 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLDN3O15551 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLDN3O15551 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLDN3O15551 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLDN3O15551 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLDN3O15551 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLDN3O15551 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CLDN3O15551 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLDN3O15551 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLDN3O15551 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLDN3O15551 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CLDN3O15551 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLDN3O15551 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLDN3O15551 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLDN3O15551 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLDN3O15551 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLDN3O15551 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLDN3O15551 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLDN3O15551 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLDN3O15551 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CLDN3O15551 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLDN3O15551 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLDN3O15551 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLDN3O15551 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLDN3O15551 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLDN3O15551 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLDN3O15551 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLDN3O15551 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CLDN3O15551 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLDN3O15551 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLDN3O15551 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CLDN3O15551 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLDN3O15551 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLDN3O15551 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLDN3O15551 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLDN3O15551 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CLDN3O15551 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLDN3O15551 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLDN3O15551 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLDN3O15551 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLDN3O15551 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLDN3O15551 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CLDN3O15551 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CLDN3O15551 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLDN3O15551 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLDN3O15551 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLDN3O15551 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLDN3O15551 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLDN3O15551 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLDN3O15551 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLDN3O15551 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLDN3O15551 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms