Protein–RNA interactions for Protein: O15230

LAMA5, Laminin subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 3,695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5O15230 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LAMA5O15230 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LAMA5O15230 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA5O15230 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA5O15230 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA5O15230 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA5O15230 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA5O15230 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA5O15230 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA5O15230 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA5O15230 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA5O15230 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA5O15230 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA5O15230 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA5O15230 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA5O15230 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA5O15230 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA5O15230 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA5O15230 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA5O15230 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA5O15230 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA5O15230 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA5O15230 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA5O15230 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA5O15230 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA5O15230 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA5O15230 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMA5O15230 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMA5O15230 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMA5O15230 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMA5O15230 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMA5O15230 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMA5O15230 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMA5O15230 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMA5O15230 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMA5O15230 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMA5O15230 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMA5O15230 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMA5O15230 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMA5O15230 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMA5O15230 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMA5O15230 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMA5O15230 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMA5O15230 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMA5O15230 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMA5O15230 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMA5O15230 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMA5O15230 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMA5O15230 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMA5O15230 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMA5O15230 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMA5O15230 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMA5O15230 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMA5O15230 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMA5O15230 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMA5O15230 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMA5O15230 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMA5O15230 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMA5O15230 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMA5O15230 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMA5O15230 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMA5O15230 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMA5O15230 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMA5O15230 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMA5O15230 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMA5O15230 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMA5O15230 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMA5O15230 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMA5O15230 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMA5O15230 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMA5O15230 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMA5O15230 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMA5O15230 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMA5O15230 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMA5O15230 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMA5O15230 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMA5O15230 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMA5O15230 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMA5O15230 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMA5O15230 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMA5O15230 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMA5O15230 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
LAMA5O15230 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
LAMA5O15230 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMA5O15230 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMA5O15230 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMA5O15230 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMA5O15230 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMA5O15230 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMA5O15230 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMA5O15230 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMA5O15230 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMA5O15230 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMA5O15230 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMA5O15230 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMA5O15230 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMA5O15230 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMA5O15230 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMA5O15230 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMA5O15230 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms