Protein–RNA interactions for Protein: O15111

CHUK, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHUKO15111 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHUKO15111 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHUKO15111 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHUKO15111 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHUKO15111 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHUKO15111 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHUKO15111 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHUKO15111 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHUKO15111 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHUKO15111 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHUKO15111 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHUKO15111 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHUKO15111 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHUKO15111 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CHUKO15111 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHUKO15111 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHUKO15111 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHUKO15111 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHUKO15111 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHUKO15111 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHUKO15111 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHUKO15111 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHUKO15111 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHUKO15111 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHUKO15111 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHUKO15111 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHUKO15111 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHUKO15111 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHUKO15111 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHUKO15111 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHUKO15111 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHUKO15111 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHUKO15111 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHUKO15111 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHUKO15111 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHUKO15111 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHUKO15111 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CHUKO15111 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHUKO15111 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHUKO15111 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHUKO15111 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHUKO15111 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHUKO15111 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHUKO15111 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHUKO15111 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHUKO15111 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHUKO15111 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHUKO15111 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHUKO15111 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHUKO15111 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHUKO15111 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHUKO15111 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHUKO15111 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHUKO15111 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHUKO15111 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CHUKO15111 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHUKO15111 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHUKO15111 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CHUKO15111 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHUKO15111 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHUKO15111 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHUKO15111 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHUKO15111 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHUKO15111 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHUKO15111 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHUKO15111 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHUKO15111 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHUKO15111 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHUKO15111 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHUKO15111 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHUKO15111 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CHUKO15111 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CHUKO15111 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHUKO15111 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHUKO15111 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHUKO15111 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHUKO15111 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHUKO15111 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHUKO15111 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHUKO15111 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHUKO15111 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHUKO15111 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHUKO15111 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHUKO15111 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CHUKO15111 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHUKO15111 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CHUKO15111 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHUKO15111 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHUKO15111 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHUKO15111 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHUKO15111 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHUKO15111 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHUKO15111 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHUKO15111 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHUKO15111 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHUKO15111 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHUKO15111 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHUKO15111 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHUKO15111 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHUKO15111 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms