Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLGNO14967 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLGNO14967 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLGNO14967 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLGNO14967 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLGNO14967 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLGNO14967 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLGNO14967 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLGNO14967 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLGNO14967 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLGNO14967 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLGNO14967 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLGNO14967 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLGNO14967 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLGNO14967 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLGNO14967 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLGNO14967 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLGNO14967 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLGNO14967 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLGNO14967 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLGNO14967 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLGNO14967 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLGNO14967 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLGNO14967 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLGNO14967 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLGNO14967 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CLGNO14967 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLGNO14967 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLGNO14967 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLGNO14967 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CLGNO14967 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLGNO14967 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLGNO14967 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CLGNO14967 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLGNO14967 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLGNO14967 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLGNO14967 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLGNO14967 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLGNO14967 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLGNO14967 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLGNO14967 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLGNO14967 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLGNO14967 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLGNO14967 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLGNO14967 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLGNO14967 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLGNO14967 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLGNO14967 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLGNO14967 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CLGNO14967 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLGNO14967 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CLGNO14967 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLGNO14967 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLGNO14967 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLGNO14967 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLGNO14967 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLGNO14967 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLGNO14967 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLGNO14967 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLGNO14967 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLGNO14967 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLGNO14967 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLGNO14967 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLGNO14967 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLGNO14967 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CLGNO14967 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLGNO14967 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLGNO14967 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLGNO14967 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLGNO14967 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLGNO14967 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLGNO14967 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLGNO14967 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLGNO14967 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLGNO14967 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLGNO14967 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLGNO14967 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLGNO14967 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLGNO14967 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLGNO14967 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLGNO14967 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLGNO14967 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLGNO14967 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLGNO14967 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLGNO14967 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLGNO14967 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLGNO14967 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLGNO14967 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLGNO14967 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLGNO14967 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLGNO14967 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLGNO14967 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLGNO14967 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLGNO14967 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLGNO14967 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLGNO14967 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLGNO14967 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLGNO14967 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLGNO14967 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLGNO14967 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms