Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BCKDKO14874 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCKDKO14874 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCKDKO14874 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BCKDKO14874 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCKDKO14874 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCKDKO14874 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCKDKO14874 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCKDKO14874 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCKDKO14874 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCKDKO14874 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCKDKO14874 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCKDKO14874 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCKDKO14874 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCKDKO14874 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCKDKO14874 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCKDKO14874 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCKDKO14874 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BCKDKO14874 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCKDKO14874 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCKDKO14874 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCKDKO14874 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCKDKO14874 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCKDKO14874 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCKDKO14874 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCKDKO14874 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCKDKO14874 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCKDKO14874 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCKDKO14874 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCKDKO14874 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCKDKO14874 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
BCKDKO14874 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
BCKDKO14874 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCKDKO14874 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCKDKO14874 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCKDKO14874 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCKDKO14874 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCKDKO14874 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCKDKO14874 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCKDKO14874 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCKDKO14874 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCKDKO14874 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCKDKO14874 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BCKDKO14874 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BCKDKO14874 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BCKDKO14874 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCKDKO14874 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BCKDKO14874 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCKDKO14874 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCKDKO14874 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCKDKO14874 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCKDKO14874 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCKDKO14874 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCKDKO14874 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCKDKO14874 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCKDKO14874 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCKDKO14874 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCKDKO14874 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCKDKO14874 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCKDKO14874 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCKDKO14874 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCKDKO14874 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCKDKO14874 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCKDKO14874 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BCKDKO14874 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BCKDKO14874 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
BCKDKO14874 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BCKDKO14874 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BCKDKO14874 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCKDKO14874 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCKDKO14874 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCKDKO14874 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCKDKO14874 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCKDKO14874 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCKDKO14874 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCKDKO14874 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCKDKO14874 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCKDKO14874 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCKDKO14874 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCKDKO14874 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BCKDKO14874 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCKDKO14874 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCKDKO14874 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCKDKO14874 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCKDKO14874 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCKDKO14874 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCKDKO14874 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCKDKO14874 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCKDKO14874 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCKDKO14874 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCKDKO14874 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCKDKO14874 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCKDKO14874 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCKDKO14874 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCKDKO14874 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCKDKO14874 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCKDKO14874 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCKDKO14874 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCKDKO14874 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCKDKO14874 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms