Protein–RNA interactions for Protein: O14777

NDC80, Kinetochore protein NDC80 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC80O14777 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDC80O14777 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDC80O14777 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDC80O14777 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDC80O14777 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NDC80O14777 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NDC80O14777 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NDC80O14777 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NDC80O14777 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NDC80O14777 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NDC80O14777 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NDC80O14777 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NDC80O14777 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NDC80O14777 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NDC80O14777 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NDC80O14777 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NDC80O14777 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDC80O14777 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDC80O14777 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDC80O14777 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDC80O14777 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDC80O14777 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDC80O14777 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDC80O14777 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDC80O14777 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDC80O14777 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDC80O14777 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDC80O14777 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDC80O14777 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDC80O14777 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDC80O14777 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDC80O14777 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDC80O14777 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NDC80O14777 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDC80O14777 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDC80O14777 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDC80O14777 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDC80O14777 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDC80O14777 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDC80O14777 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDC80O14777 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDC80O14777 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDC80O14777 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDC80O14777 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDC80O14777 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDC80O14777 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDC80O14777 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDC80O14777 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDC80O14777 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDC80O14777 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDC80O14777 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDC80O14777 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDC80O14777 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDC80O14777 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDC80O14777 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NDC80O14777 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NDC80O14777 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDC80O14777 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDC80O14777 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDC80O14777 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDC80O14777 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDC80O14777 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NDC80O14777 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NDC80O14777 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NDC80O14777 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NDC80O14777 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NDC80O14777 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NDC80O14777 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NDC80O14777 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NDC80O14777 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NDC80O14777 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NDC80O14777 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NDC80O14777 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDC80O14777 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NDC80O14777 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDC80O14777 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDC80O14777 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDC80O14777 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDC80O14777 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDC80O14777 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDC80O14777 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDC80O14777 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDC80O14777 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDC80O14777 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDC80O14777 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDC80O14777 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDC80O14777 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDC80O14777 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDC80O14777 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDC80O14777 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDC80O14777 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDC80O14777 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDC80O14777 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDC80O14777 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDC80O14777 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDC80O14777 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDC80O14777 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDC80O14777 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDC80O14777 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDC80O14777 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms