Protein–RNA interactions for Protein: O00322

UPK1A, Uroplakin-1a, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK1AO00322 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPK1AO00322 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPK1AO00322 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UPK1AO00322 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UPK1AO00322 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UPK1AO00322 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
UPK1AO00322 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPK1AO00322 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPK1AO00322 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPK1AO00322 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPK1AO00322 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPK1AO00322 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPK1AO00322 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPK1AO00322 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPK1AO00322 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPK1AO00322 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPK1AO00322 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPK1AO00322 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPK1AO00322 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPK1AO00322 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPK1AO00322 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPK1AO00322 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UPK1AO00322 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPK1AO00322 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPK1AO00322 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPK1AO00322 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPK1AO00322 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPK1AO00322 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPK1AO00322 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPK1AO00322 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPK1AO00322 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPK1AO00322 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPK1AO00322 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPK1AO00322 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPK1AO00322 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPK1AO00322 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPK1AO00322 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPK1AO00322 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPK1AO00322 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPK1AO00322 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UPK1AO00322 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPK1AO00322 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UPK1AO00322 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPK1AO00322 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UPK1AO00322 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPK1AO00322 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPK1AO00322 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPK1AO00322 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPK1AO00322 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPK1AO00322 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPK1AO00322 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPK1AO00322 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPK1AO00322 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPK1AO00322 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPK1AO00322 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPK1AO00322 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPK1AO00322 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPK1AO00322 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPK1AO00322 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPK1AO00322 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPK1AO00322 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPK1AO00322 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPK1AO00322 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
UPK1AO00322 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPK1AO00322 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPK1AO00322 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPK1AO00322 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UPK1AO00322 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UPK1AO00322 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPK1AO00322 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPK1AO00322 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPK1AO00322 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPK1AO00322 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPK1AO00322 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPK1AO00322 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPK1AO00322 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPK1AO00322 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPK1AO00322 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPK1AO00322 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPK1AO00322 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPK1AO00322 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPK1AO00322 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPK1AO00322 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPK1AO00322 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPK1AO00322 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPK1AO00322 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPK1AO00322 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPK1AO00322 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPK1AO00322 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPK1AO00322 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPK1AO00322 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPK1AO00322 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPK1AO00322 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPK1AO00322 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPK1AO00322 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPK1AO00322 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPK1AO00322 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPK1AO00322 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPK1AO00322 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPK1AO00322 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms