Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NFKBIEO00221 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NFKBIEO00221 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NFKBIEO00221 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
NFKBIEO00221 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NFKBIEO00221 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NFKBIEO00221 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
NFKBIEO00221 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
NFKBIEO00221 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NFKBIEO00221 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NFKBIEO00221 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NFKBIEO00221 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NFKBIEO00221 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NFKBIEO00221 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NFKBIEO00221 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NFKBIEO00221 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NFKBIEO00221 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NFKBIEO00221 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NFKBIEO00221 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
NFKBIEO00221 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NFKBIEO00221 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NFKBIEO00221 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NFKBIEO00221 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NFKBIEO00221 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NFKBIEO00221 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NFKBIEO00221 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NFKBIEO00221 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NFKBIEO00221 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NFKBIEO00221 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NFKBIEO00221 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NFKBIEO00221 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NFKBIEO00221 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NFKBIEO00221 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NFKBIEO00221 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NFKBIEO00221 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NFKBIEO00221 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NFKBIEO00221 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NFKBIEO00221 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NFKBIEO00221 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NFKBIEO00221 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NFKBIEO00221 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
NFKBIEO00221 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
NFKBIEO00221 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NFKBIEO00221 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NFKBIEO00221 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NFKBIEO00221 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NFKBIEO00221 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NFKBIEO00221 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NFKBIEO00221 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NFKBIEO00221 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NFKBIEO00221 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NFKBIEO00221 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NFKBIEO00221 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NFKBIEO00221 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NFKBIEO00221 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NFKBIEO00221 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NFKBIEO00221 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
NFKBIEO00221 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NFKBIEO00221 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
NFKBIEO00221 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
NFKBIEO00221 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NFKBIEO00221 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NFKBIEO00221 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NFKBIEO00221 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NFKBIEO00221 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NFKBIEO00221 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NFKBIEO00221 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NFKBIEO00221 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NFKBIEO00221 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NFKBIEO00221 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
NFKBIEO00221 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NFKBIEO00221 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
NFKBIEO00221 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
NFKBIEO00221 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NFKBIEO00221 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
NFKBIEO00221 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NFKBIEO00221 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NFKBIEO00221 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NFKBIEO00221 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
NFKBIEO00221 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
NFKBIEO00221 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NFKBIEO00221 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
NFKBIEO00221 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
NFKBIEO00221 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NFKBIEO00221 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
NFKBIEO00221 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NFKBIEO00221 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NFKBIEO00221 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NFKBIEO00221 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NFKBIEO00221 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NFKBIEO00221 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NFKBIEO00221 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NFKBIEO00221 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
NFKBIEO00221 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC29■■■□□ 2.23
NFKBIEO00221 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NFKBIEO00221 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC29■■■□□ 2.23
NFKBIEO00221 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NFKBIEO00221 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NFKBIEO00221 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
NFKBIEO00221 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms