Protein–RNA interactions for Protein: O00203

AP3B1, AP-3 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B1O00203 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AP3B1O00203 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AP3B1O00203 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AP3B1O00203 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
AP3B1O00203 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
AP3B1O00203 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
AP3B1O00203 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AP3B1O00203 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AP3B1O00203 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AP3B1O00203 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AP3B1O00203 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AP3B1O00203 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AP3B1O00203 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
AP3B1O00203 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AP3B1O00203 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AP3B1O00203 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AP3B1O00203 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AP3B1O00203 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AP3B1O00203 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AP3B1O00203 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AP3B1O00203 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AP3B1O00203 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AP3B1O00203 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AP3B1O00203 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AP3B1O00203 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AP3B1O00203 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AP3B1O00203 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AP3B1O00203 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AP3B1O00203 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AP3B1O00203 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AP3B1O00203 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AP3B1O00203 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AP3B1O00203 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AP3B1O00203 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
AP3B1O00203 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AP3B1O00203 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AP3B1O00203 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AP3B1O00203 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AP3B1O00203 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AP3B1O00203 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AP3B1O00203 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AP3B1O00203 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AP3B1O00203 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
AP3B1O00203 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AP3B1O00203 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP3B1O00203 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP3B1O00203 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP3B1O00203 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP3B1O00203 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP3B1O00203 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP3B1O00203 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP3B1O00203 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP3B1O00203 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP3B1O00203 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP3B1O00203 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP3B1O00203 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP3B1O00203 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP3B1O00203 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP3B1O00203 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
AP3B1O00203 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AP3B1O00203 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
AP3B1O00203 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AP3B1O00203 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AP3B1O00203 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AP3B1O00203 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AP3B1O00203 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AP3B1O00203 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AP3B1O00203 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AP3B1O00203 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AP3B1O00203 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AP3B1O00203 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AP3B1O00203 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AP3B1O00203 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AP3B1O00203 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
AP3B1O00203 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AP3B1O00203 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AP3B1O00203 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AP3B1O00203 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AP3B1O00203 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
AP3B1O00203 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
AP3B1O00203 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AP3B1O00203 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
AP3B1O00203 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AP3B1O00203 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP3B1O00203 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP3B1O00203 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP3B1O00203 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP3B1O00203 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP3B1O00203 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP3B1O00203 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP3B1O00203 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP3B1O00203 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
AP3B1O00203 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AP3B1O00203 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AP3B1O00203 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AP3B1O00203 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AP3B1O00203 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AP3B1O00203 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AP3B1O00203 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP3B1O00203 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms