Protein–RNA interactions for Protein: O00159

MYO1C, Unconventional myosin-Ic, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1CO00159 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYO1CO00159 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYO1CO00159 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYO1CO00159 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYO1CO00159 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYO1CO00159 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYO1CO00159 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYO1CO00159 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYO1CO00159 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MYO1CO00159 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYO1CO00159 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYO1CO00159 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MYO1CO00159 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYO1CO00159 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYO1CO00159 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MYO1CO00159 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYO1CO00159 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYO1CO00159 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYO1CO00159 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYO1CO00159 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYO1CO00159 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYO1CO00159 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYO1CO00159 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYO1CO00159 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYO1CO00159 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MYO1CO00159 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYO1CO00159 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYO1CO00159 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYO1CO00159 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYO1CO00159 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYO1CO00159 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYO1CO00159 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYO1CO00159 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYO1CO00159 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYO1CO00159 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYO1CO00159 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYO1CO00159 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYO1CO00159 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYO1CO00159 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYO1CO00159 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYO1CO00159 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYO1CO00159 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYO1CO00159 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYO1CO00159 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYO1CO00159 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYO1CO00159 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYO1CO00159 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYO1CO00159 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYO1CO00159 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MYO1CO00159 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYO1CO00159 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYO1CO00159 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYO1CO00159 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYO1CO00159 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYO1CO00159 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYO1CO00159 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYO1CO00159 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYO1CO00159 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MYO1CO00159 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MYO1CO00159 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MYO1CO00159 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MYO1CO00159 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MYO1CO00159 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MYO1CO00159 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MYO1CO00159 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MYO1CO00159 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MYO1CO00159 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MYO1CO00159 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MYO1CO00159 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYO1CO00159 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYO1CO00159 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYO1CO00159 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYO1CO00159 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYO1CO00159 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYO1CO00159 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYO1CO00159 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYO1CO00159 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYO1CO00159 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYO1CO00159 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYO1CO00159 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYO1CO00159 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYO1CO00159 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYO1CO00159 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYO1CO00159 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYO1CO00159 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYO1CO00159 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYO1CO00159 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYO1CO00159 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYO1CO00159 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYO1CO00159 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYO1CO00159 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYO1CO00159 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYO1CO00159 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYO1CO00159 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYO1CO00159 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYO1CO00159 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYO1CO00159 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYO1CO00159 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYO1CO00159 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYO1CO00159 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms