Protein–RNA interactions for Protein: I3L3M4

Claudin, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
I3L3M4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
I3L3M4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
I3L3M4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
I3L3M4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
I3L3M4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
I3L3M4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
I3L3M4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
I3L3M4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
I3L3M4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
I3L3M4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
I3L3M4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
I3L3M4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
I3L3M4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
I3L3M4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
I3L3M4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
I3L3M4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
I3L3M4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
I3L3M4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
I3L3M4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
I3L3M4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
I3L3M4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
I3L3M4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
I3L3M4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
I3L3M4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
I3L3M4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
I3L3M4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
I3L3M4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
I3L3M4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
I3L3M4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
I3L3M4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
I3L3M4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
I3L3M4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
I3L3M4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
I3L3M4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
I3L3M4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
I3L3M4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
I3L3M4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
I3L3M4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
I3L3M4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
I3L3M4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
I3L3M4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
I3L3M4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
I3L3M4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
I3L3M4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
I3L3M4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
I3L3M4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
I3L3M4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
I3L3M4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
I3L3M4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
I3L3M4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
I3L3M4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
I3L3M4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
I3L3M4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
I3L3M4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
I3L3M4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
I3L3M4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
I3L3M4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
I3L3M4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
I3L3M4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
I3L3M4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
I3L3M4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
I3L3M4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
I3L3M4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
I3L3M4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
I3L3M4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
I3L3M4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
I3L3M4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
I3L3M4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
I3L3M4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
I3L3M4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
I3L3M4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
I3L3M4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
I3L3M4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
I3L3M4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
I3L3M4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
I3L3M4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
I3L3M4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
I3L3M4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
I3L3M4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
I3L3M4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
I3L3M4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
I3L3M4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
I3L3M4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
I3L3M4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
I3L3M4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
I3L3M4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
I3L3M4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
I3L3M4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
I3L3M4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
I3L3M4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
I3L3M4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
I3L3M4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
I3L3M4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
I3L3M4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
I3L3M4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
I3L3M4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
I3L3M4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
I3L3M4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
I3L3M4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
I3L3M4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms