Protein–RNA interactions for Protein: H3BNC9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNC9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
H3BNC9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
H3BNC9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
H3BNC9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
H3BNC9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
H3BNC9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
H3BNC9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
H3BNC9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
H3BNC9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
H3BNC9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
H3BNC9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
H3BNC9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
H3BNC9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
H3BNC9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
H3BNC9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
H3BNC9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
H3BNC9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
H3BNC9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
H3BNC9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
H3BNC9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
H3BNC9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
H3BNC9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
H3BNC9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
H3BNC9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
H3BNC9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
H3BNC9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
H3BNC9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
H3BNC9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
H3BNC9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
H3BNC9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
H3BNC9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
H3BNC9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
H3BNC9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
H3BNC9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
H3BNC9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
H3BNC9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
H3BNC9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
H3BNC9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
H3BNC9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
H3BNC9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
H3BNC9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
H3BNC9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
H3BNC9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H3BNC9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
H3BNC9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H3BNC9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H3BNC9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
H3BNC9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H3BNC9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
H3BNC9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
H3BNC9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
H3BNC9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
H3BNC9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
H3BNC9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
H3BNC9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
H3BNC9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
H3BNC9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
H3BNC9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
H3BNC9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
H3BNC9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
H3BNC9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
H3BNC9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
H3BNC9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
H3BNC9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
H3BNC9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
H3BNC9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
H3BNC9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
H3BNC9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
H3BNC9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
H3BNC9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
H3BNC9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
H3BNC9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
H3BNC9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
H3BNC9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
H3BNC9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
H3BNC9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
H3BNC9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
H3BNC9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
H3BNC9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
H3BNC9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
H3BNC9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
H3BNC9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
H3BNC9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
H3BNC9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
H3BNC9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
H3BNC9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
H3BNC9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
H3BNC9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
H3BNC9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
H3BNC9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
H3BNC9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
H3BNC9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
H3BNC9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
H3BNC9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
H3BNC9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
H3BNC9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
H3BNC9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
H3BNC9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
H3BNC9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
H3BNC9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms