Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

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Length 899 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRRT4C9JH25 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRRT4C9JH25 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PRRT4C9JH25 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PRRT4C9JH25 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRRT4C9JH25 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRRT4C9JH25 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRRT4C9JH25 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRRT4C9JH25 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRRT4C9JH25 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PRRT4C9JH25 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRRT4C9JH25 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRRT4C9JH25 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PRRT4C9JH25 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRRT4C9JH25 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRRT4C9JH25 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRRT4C9JH25 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRRT4C9JH25 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRRT4C9JH25 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRRT4C9JH25 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRRT4C9JH25 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRRT4C9JH25 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRRT4C9JH25 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRRT4C9JH25 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRRT4C9JH25 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRRT4C9JH25 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRRT4C9JH25 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRRT4C9JH25 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRRT4C9JH25 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRRT4C9JH25 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRRT4C9JH25 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PRRT4C9JH25 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRRT4C9JH25 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRRT4C9JH25 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRRT4C9JH25 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRRT4C9JH25 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRRT4C9JH25 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRRT4C9JH25 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRRT4C9JH25 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRRT4C9JH25 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRRT4C9JH25 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRRT4C9JH25 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRRT4C9JH25 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRRT4C9JH25 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRRT4C9JH25 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRRT4C9JH25 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRRT4C9JH25 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRRT4C9JH25 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRRT4C9JH25 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PRRT4C9JH25 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRRT4C9JH25 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRRT4C9JH25 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRRT4C9JH25 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRRT4C9JH25 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRRT4C9JH25 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRRT4C9JH25 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRRT4C9JH25 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRRT4C9JH25 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRRT4C9JH25 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRRT4C9JH25 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRRT4C9JH25 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRRT4C9JH25 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRRT4C9JH25 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PRRT4C9JH25 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRRT4C9JH25 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRRT4C9JH25 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRRT4C9JH25 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PRRT4C9JH25 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRRT4C9JH25 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRRT4C9JH25 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRRT4C9JH25 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRRT4C9JH25 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRRT4C9JH25 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRRT4C9JH25 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRRT4C9JH25 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PRRT4C9JH25 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PRRT4C9JH25 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRRT4C9JH25 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRRT4C9JH25 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRRT4C9JH25 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRRT4C9JH25 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRRT4C9JH25 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRRT4C9JH25 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRRT4C9JH25 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRRT4C9JH25 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRRT4C9JH25 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRRT4C9JH25 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRRT4C9JH25 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRRT4C9JH25 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRRT4C9JH25 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRRT4C9JH25 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRRT4C9JH25 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRRT4C9JH25 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRRT4C9JH25 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRRT4C9JH25 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRRT4C9JH25 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PRRT4C9JH25 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRRT4C9JH25 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRRT4C9JH25 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRRT4C9JH25 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
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