Protein–RNA interactions for Protein: C9J3I9

C5orf58, Putative uncharacterized protein C5orf58, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf58C9J3I9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C5orf58C9J3I9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C5orf58C9J3I9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C5orf58C9J3I9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C5orf58C9J3I9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C5orf58C9J3I9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C5orf58C9J3I9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C5orf58C9J3I9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C5orf58C9J3I9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C5orf58C9J3I9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C5orf58C9J3I9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C5orf58C9J3I9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C5orf58C9J3I9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C5orf58C9J3I9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C5orf58C9J3I9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C5orf58C9J3I9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C5orf58C9J3I9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C5orf58C9J3I9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C5orf58C9J3I9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C5orf58C9J3I9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf58C9J3I9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf58C9J3I9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf58C9J3I9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf58C9J3I9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf58C9J3I9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf58C9J3I9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf58C9J3I9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf58C9J3I9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C5orf58C9J3I9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C5orf58C9J3I9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C5orf58C9J3I9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C5orf58C9J3I9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C5orf58C9J3I9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C5orf58C9J3I9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C5orf58C9J3I9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C5orf58C9J3I9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C5orf58C9J3I9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C5orf58C9J3I9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C5orf58C9J3I9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C5orf58C9J3I9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C5orf58C9J3I9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C5orf58C9J3I9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C5orf58C9J3I9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C5orf58C9J3I9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C5orf58C9J3I9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C5orf58C9J3I9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C5orf58C9J3I9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C5orf58C9J3I9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C5orf58C9J3I9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C5orf58C9J3I9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C5orf58C9J3I9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C5orf58C9J3I9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C5orf58C9J3I9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C5orf58C9J3I9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C5orf58C9J3I9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C5orf58C9J3I9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C5orf58C9J3I9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C5orf58C9J3I9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C5orf58C9J3I9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C5orf58C9J3I9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C5orf58C9J3I9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C5orf58C9J3I9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22■■□□□ 1.11
C5orf58C9J3I9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C5orf58C9J3I9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C5orf58C9J3I9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C5orf58C9J3I9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C5orf58C9J3I9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C5orf58C9J3I9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C5orf58C9J3I9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C5orf58C9J3I9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C5orf58C9J3I9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C5orf58C9J3I9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C5orf58C9J3I9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C5orf58C9J3I9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C5orf58C9J3I9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C5orf58C9J3I9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C5orf58C9J3I9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C5orf58C9J3I9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C5orf58C9J3I9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C5orf58C9J3I9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C5orf58C9J3I9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C5orf58C9J3I9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C5orf58C9J3I9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C5orf58C9J3I9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C5orf58C9J3I9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C5orf58C9J3I9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C5orf58C9J3I9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C5orf58C9J3I9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C5orf58C9J3I9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C5orf58C9J3I9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C5orf58C9J3I9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C5orf58C9J3I9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
C5orf58C9J3I9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C5orf58C9J3I9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C5orf58C9J3I9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C5orf58C9J3I9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C5orf58C9J3I9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C5orf58C9J3I9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C5orf58C9J3I9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C5orf58C9J3I9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms