Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ERVV-1B6SEH8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ERVV-1B6SEH8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ERVV-1B6SEH8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ERVV-1B6SEH8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ERVV-1B6SEH8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ERVV-1B6SEH8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ERVV-1B6SEH8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ERVV-1B6SEH8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
ERVV-1B6SEH8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
ERVV-1B6SEH8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
ERVV-1B6SEH8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
ERVV-1B6SEH8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
ERVV-1B6SEH8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ERVV-1B6SEH8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ERVV-1B6SEH8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ERVV-1B6SEH8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ERVV-1B6SEH8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
ERVV-1B6SEH8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ERVV-1B6SEH8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
ERVV-1B6SEH8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ERVV-1B6SEH8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ERVV-1B6SEH8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ERVV-1B6SEH8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ERVV-1B6SEH8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ERVV-1B6SEH8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ERVV-1B6SEH8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ERVV-1B6SEH8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ERVV-1B6SEH8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
ERVV-1B6SEH8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ERVV-1B6SEH8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ERVV-1B6SEH8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ERVV-1B6SEH8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
ERVV-1B6SEH8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ERVV-1B6SEH8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ERVV-1B6SEH8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ERVV-1B6SEH8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ERVV-1B6SEH8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ERVV-1B6SEH8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ERVV-1B6SEH8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ERVV-1B6SEH8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ERVV-1B6SEH8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
ERVV-1B6SEH8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ERVV-1B6SEH8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ERVV-1B6SEH8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ERVV-1B6SEH8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
ERVV-1B6SEH8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ERVV-1B6SEH8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ERVV-1B6SEH8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ERVV-1B6SEH8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ERVV-1B6SEH8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ERVV-1B6SEH8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ERVV-1B6SEH8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ERVV-1B6SEH8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ERVV-1B6SEH8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ERVV-1B6SEH8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ERVV-1B6SEH8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ERVV-1B6SEH8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ERVV-1B6SEH8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ERVV-1B6SEH8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ERVV-1B6SEH8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ERVV-1B6SEH8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ERVV-1B6SEH8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ERVV-1B6SEH8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ERVV-1B6SEH8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ERVV-1B6SEH8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ERVV-1B6SEH8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ERVV-1B6SEH8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ERVV-1B6SEH8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ERVV-1B6SEH8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ERVV-1B6SEH8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ERVV-1B6SEH8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ERVV-1B6SEH8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ERVV-1B6SEH8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ERVV-1B6SEH8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ERVV-1B6SEH8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ERVV-1B6SEH8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ERVV-1B6SEH8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ERVV-1B6SEH8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ERVV-1B6SEH8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.37
ERVV-1B6SEH8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ERVV-1B6SEH8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ERVV-1B6SEH8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
ERVV-1B6SEH8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ERVV-1B6SEH8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ERVV-1B6SEH8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ERVV-1B6SEH8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ERVV-1B6SEH8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ERVV-1B6SEH8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
ERVV-1B6SEH8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ERVV-1B6SEH8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ERVV-1B6SEH8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ERVV-1B6SEH8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ERVV-1B6SEH8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ERVV-1B6SEH8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ERVV-1B6SEH8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ERVV-1B6SEH8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ERVV-1B6SEH8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
ERVV-1B6SEH8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ERVV-1B6SEH8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms