Protein–RNA interactions for Protein: B3SHH9

TMEM114, Transmembrane protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM114B3SHH9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM114B3SHH9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM114B3SHH9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM114B3SHH9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM114B3SHH9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM114B3SHH9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM114B3SHH9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM114B3SHH9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM114B3SHH9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM114B3SHH9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM114B3SHH9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM114B3SHH9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM114B3SHH9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM114B3SHH9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM114B3SHH9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM114B3SHH9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM114B3SHH9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM114B3SHH9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM114B3SHH9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM114B3SHH9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM114B3SHH9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM114B3SHH9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM114B3SHH9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM114B3SHH9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM114B3SHH9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM114B3SHH9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM114B3SHH9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM114B3SHH9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM114B3SHH9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM114B3SHH9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM114B3SHH9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM114B3SHH9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM114B3SHH9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM114B3SHH9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM114B3SHH9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM114B3SHH9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM114B3SHH9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM114B3SHH9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM114B3SHH9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM114B3SHH9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM114B3SHH9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM114B3SHH9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM114B3SHH9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM114B3SHH9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM114B3SHH9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM114B3SHH9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM114B3SHH9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM114B3SHH9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM114B3SHH9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM114B3SHH9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM114B3SHH9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM114B3SHH9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM114B3SHH9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM114B3SHH9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM114B3SHH9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM114B3SHH9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM114B3SHH9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM114B3SHH9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM114B3SHH9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM114B3SHH9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM114B3SHH9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM114B3SHH9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM114B3SHH9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM114B3SHH9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM114B3SHH9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM114B3SHH9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM114B3SHH9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM114B3SHH9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM114B3SHH9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM114B3SHH9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM114B3SHH9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM114B3SHH9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM114B3SHH9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM114B3SHH9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM114B3SHH9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM114B3SHH9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM114B3SHH9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM114B3SHH9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM114B3SHH9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM114B3SHH9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM114B3SHH9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM114B3SHH9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM114B3SHH9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM114B3SHH9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM114B3SHH9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM114B3SHH9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM114B3SHH9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM114B3SHH9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM114B3SHH9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM114B3SHH9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM114B3SHH9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM114B3SHH9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM114B3SHH9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM114B3SHH9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM114B3SHH9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM114B3SHH9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM114B3SHH9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM114B3SHH9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM114B3SHH9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM114B3SHH9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms