Protein–RNA interactions for Protein: A8MUK1

USP17L5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L5A8MUK1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP17L5A8MUK1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP17L5A8MUK1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP17L5A8MUK1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
USP17L5A8MUK1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP17L5A8MUK1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP17L5A8MUK1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP17L5A8MUK1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
USP17L5A8MUK1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP17L5A8MUK1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP17L5A8MUK1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP17L5A8MUK1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP17L5A8MUK1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP17L5A8MUK1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP17L5A8MUK1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP17L5A8MUK1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
USP17L5A8MUK1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP17L5A8MUK1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP17L5A8MUK1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP17L5A8MUK1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP17L5A8MUK1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP17L5A8MUK1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP17L5A8MUK1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP17L5A8MUK1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP17L5A8MUK1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP17L5A8MUK1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP17L5A8MUK1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP17L5A8MUK1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP17L5A8MUK1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP17L5A8MUK1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP17L5A8MUK1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP17L5A8MUK1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
USP17L5A8MUK1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
USP17L5A8MUK1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP17L5A8MUK1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP17L5A8MUK1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP17L5A8MUK1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP17L5A8MUK1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP17L5A8MUK1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP17L5A8MUK1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP17L5A8MUK1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP17L5A8MUK1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP17L5A8MUK1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP17L5A8MUK1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP17L5A8MUK1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
USP17L5A8MUK1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP17L5A8MUK1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP17L5A8MUK1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP17L5A8MUK1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP17L5A8MUK1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP17L5A8MUK1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP17L5A8MUK1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP17L5A8MUK1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP17L5A8MUK1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP17L5A8MUK1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP17L5A8MUK1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP17L5A8MUK1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP17L5A8MUK1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP17L5A8MUK1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP17L5A8MUK1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP17L5A8MUK1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP17L5A8MUK1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP17L5A8MUK1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP17L5A8MUK1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP17L5A8MUK1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
USP17L5A8MUK1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP17L5A8MUK1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP17L5A8MUK1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP17L5A8MUK1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP17L5A8MUK1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP17L5A8MUK1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP17L5A8MUK1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP17L5A8MUK1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP17L5A8MUK1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP17L5A8MUK1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP17L5A8MUK1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP17L5A8MUK1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP17L5A8MUK1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP17L5A8MUK1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
USP17L5A8MUK1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP17L5A8MUK1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP17L5A8MUK1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP17L5A8MUK1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP17L5A8MUK1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP17L5A8MUK1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP17L5A8MUK1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
USP17L5A8MUK1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP17L5A8MUK1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP17L5A8MUK1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP17L5A8MUK1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP17L5A8MUK1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP17L5A8MUK1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP17L5A8MUK1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP17L5A8MUK1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP17L5A8MUK1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP17L5A8MUK1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP17L5A8MUK1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP17L5A8MUK1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP17L5A8MUK1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP17L5A8MUK1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms