Protein–RNA interactions for Protein: A8K830

COLCA2, Colorectal cancer-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLCA2A8K830 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COLCA2A8K830 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
COLCA2A8K830 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COLCA2A8K830 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COLCA2A8K830 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COLCA2A8K830 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COLCA2A8K830 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COLCA2A8K830 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COLCA2A8K830 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COLCA2A8K830 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COLCA2A8K830 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COLCA2A8K830 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COLCA2A8K830 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COLCA2A8K830 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COLCA2A8K830 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
COLCA2A8K830 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COLCA2A8K830 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COLCA2A8K830 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COLCA2A8K830 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COLCA2A8K830 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COLCA2A8K830 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COLCA2A8K830 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COLCA2A8K830 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COLCA2A8K830 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COLCA2A8K830 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
COLCA2A8K830 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
COLCA2A8K830 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
COLCA2A8K830 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COLCA2A8K830 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COLCA2A8K830 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms