Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP27XA6NNY8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP27XA6NNY8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP27XA6NNY8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP27XA6NNY8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP27XA6NNY8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP27XA6NNY8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP27XA6NNY8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP27XA6NNY8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP27XA6NNY8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP27XA6NNY8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP27XA6NNY8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP27XA6NNY8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP27XA6NNY8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP27XA6NNY8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP27XA6NNY8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP27XA6NNY8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP27XA6NNY8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP27XA6NNY8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP27XA6NNY8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP27XA6NNY8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP27XA6NNY8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP27XA6NNY8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP27XA6NNY8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP27XA6NNY8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP27XA6NNY8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP27XA6NNY8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP27XA6NNY8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP27XA6NNY8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP27XA6NNY8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP27XA6NNY8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP27XA6NNY8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP27XA6NNY8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP27XA6NNY8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP27XA6NNY8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP27XA6NNY8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP27XA6NNY8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP27XA6NNY8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP27XA6NNY8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP27XA6NNY8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP27XA6NNY8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP27XA6NNY8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP27XA6NNY8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP27XA6NNY8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP27XA6NNY8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP27XA6NNY8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
USP27XA6NNY8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP27XA6NNY8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP27XA6NNY8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP27XA6NNY8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP27XA6NNY8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP27XA6NNY8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP27XA6NNY8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP27XA6NNY8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP27XA6NNY8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP27XA6NNY8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP27XA6NNY8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP27XA6NNY8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP27XA6NNY8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP27XA6NNY8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP27XA6NNY8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP27XA6NNY8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP27XA6NNY8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP27XA6NNY8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
USP27XA6NNY8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP27XA6NNY8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
USP27XA6NNY8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP27XA6NNY8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP27XA6NNY8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP27XA6NNY8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP27XA6NNY8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
USP27XA6NNY8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP27XA6NNY8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP27XA6NNY8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
USP27XA6NNY8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP27XA6NNY8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP27XA6NNY8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
USP27XA6NNY8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP27XA6NNY8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP27XA6NNY8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP27XA6NNY8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP27XA6NNY8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP27XA6NNY8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP27XA6NNY8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP27XA6NNY8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP27XA6NNY8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP27XA6NNY8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP27XA6NNY8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP27XA6NNY8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP27XA6NNY8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP27XA6NNY8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP27XA6NNY8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP27XA6NNY8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP27XA6NNY8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP27XA6NNY8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP27XA6NNY8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP27XA6NNY8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP27XA6NNY8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP27XA6NNY8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP27XA6NNY8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
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