Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF1

SAC3D1, SAC3 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAC3D1A6NKF1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAC3D1A6NKF1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAC3D1A6NKF1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAC3D1A6NKF1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAC3D1A6NKF1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAC3D1A6NKF1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAC3D1A6NKF1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SAC3D1A6NKF1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAC3D1A6NKF1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAC3D1A6NKF1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAC3D1A6NKF1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAC3D1A6NKF1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAC3D1A6NKF1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAC3D1A6NKF1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAC3D1A6NKF1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAC3D1A6NKF1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAC3D1A6NKF1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAC3D1A6NKF1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAC3D1A6NKF1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAC3D1A6NKF1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAC3D1A6NKF1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAC3D1A6NKF1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAC3D1A6NKF1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAC3D1A6NKF1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAC3D1A6NKF1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAC3D1A6NKF1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAC3D1A6NKF1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAC3D1A6NKF1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAC3D1A6NKF1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAC3D1A6NKF1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAC3D1A6NKF1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAC3D1A6NKF1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAC3D1A6NKF1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAC3D1A6NKF1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SAC3D1A6NKF1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SAC3D1A6NKF1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAC3D1A6NKF1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAC3D1A6NKF1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAC3D1A6NKF1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAC3D1A6NKF1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAC3D1A6NKF1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAC3D1A6NKF1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SAC3D1A6NKF1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SAC3D1A6NKF1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SAC3D1A6NKF1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAC3D1A6NKF1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAC3D1A6NKF1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAC3D1A6NKF1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAC3D1A6NKF1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAC3D1A6NKF1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAC3D1A6NKF1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAC3D1A6NKF1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAC3D1A6NKF1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAC3D1A6NKF1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAC3D1A6NKF1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAC3D1A6NKF1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAC3D1A6NKF1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SAC3D1A6NKF1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAC3D1A6NKF1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAC3D1A6NKF1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAC3D1A6NKF1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAC3D1A6NKF1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAC3D1A6NKF1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAC3D1A6NKF1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAC3D1A6NKF1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAC3D1A6NKF1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAC3D1A6NKF1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAC3D1A6NKF1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAC3D1A6NKF1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAC3D1A6NKF1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAC3D1A6NKF1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAC3D1A6NKF1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAC3D1A6NKF1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAC3D1A6NKF1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAC3D1A6NKF1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAC3D1A6NKF1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAC3D1A6NKF1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAC3D1A6NKF1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAC3D1A6NKF1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAC3D1A6NKF1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAC3D1A6NKF1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAC3D1A6NKF1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAC3D1A6NKF1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAC3D1A6NKF1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAC3D1A6NKF1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAC3D1A6NKF1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAC3D1A6NKF1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAC3D1A6NKF1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAC3D1A6NKF1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAC3D1A6NKF1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAC3D1A6NKF1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAC3D1A6NKF1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAC3D1A6NKF1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SAC3D1A6NKF1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SAC3D1A6NKF1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SAC3D1A6NKF1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SAC3D1A6NKF1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SAC3D1A6NKF1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SAC3D1A6NKF1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAC3D1A6NKF1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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