Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCNX2A6NKB5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCNX2A6NKB5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCNX2A6NKB5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PCNX2A6NKB5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCNX2A6NKB5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCNX2A6NKB5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCNX2A6NKB5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCNX2A6NKB5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCNX2A6NKB5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PCNX2A6NKB5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCNX2A6NKB5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCNX2A6NKB5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCNX2A6NKB5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCNX2A6NKB5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCNX2A6NKB5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PCNX2A6NKB5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCNX2A6NKB5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCNX2A6NKB5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCNX2A6NKB5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PCNX2A6NKB5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PCNX2A6NKB5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCNX2A6NKB5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCNX2A6NKB5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCNX2A6NKB5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCNX2A6NKB5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCNX2A6NKB5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCNX2A6NKB5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PCNX2A6NKB5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCNX2A6NKB5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCNX2A6NKB5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCNX2A6NKB5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCNX2A6NKB5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCNX2A6NKB5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PCNX2A6NKB5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCNX2A6NKB5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCNX2A6NKB5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCNX2A6NKB5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PCNX2A6NKB5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCNX2A6NKB5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCNX2A6NKB5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCNX2A6NKB5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCNX2A6NKB5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCNX2A6NKB5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCNX2A6NKB5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCNX2A6NKB5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCNX2A6NKB5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCNX2A6NKB5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCNX2A6NKB5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCNX2A6NKB5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCNX2A6NKB5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCNX2A6NKB5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCNX2A6NKB5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PCNX2A6NKB5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCNX2A6NKB5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCNX2A6NKB5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCNX2A6NKB5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCNX2A6NKB5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCNX2A6NKB5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCNX2A6NKB5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PCNX2A6NKB5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCNX2A6NKB5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCNX2A6NKB5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCNX2A6NKB5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCNX2A6NKB5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCNX2A6NKB5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCNX2A6NKB5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCNX2A6NKB5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCNX2A6NKB5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCNX2A6NKB5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCNX2A6NKB5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCNX2A6NKB5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCNX2A6NKB5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PCNX2A6NKB5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCNX2A6NKB5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCNX2A6NKB5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCNX2A6NKB5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCNX2A6NKB5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCNX2A6NKB5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCNX2A6NKB5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PCNX2A6NKB5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCNX2A6NKB5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCNX2A6NKB5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCNX2A6NKB5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCNX2A6NKB5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCNX2A6NKB5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCNX2A6NKB5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCNX2A6NKB5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCNX2A6NKB5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCNX2A6NKB5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCNX2A6NKB5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCNX2A6NKB5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCNX2A6NKB5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCNX2A6NKB5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCNX2A6NKB5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCNX2A6NKB5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCNX2A6NKB5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCNX2A6NKB5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PCNX2A6NKB5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCNX2A6NKB5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms