Protein–RNA interactions for Protein: A6NHC0

CAPN8, Calpain-8, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN8A6NHC0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPN8A6NHC0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPN8A6NHC0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPN8A6NHC0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPN8A6NHC0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPN8A6NHC0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPN8A6NHC0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPN8A6NHC0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPN8A6NHC0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPN8A6NHC0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPN8A6NHC0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPN8A6NHC0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN8A6NHC0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN8A6NHC0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN8A6NHC0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN8A6NHC0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN8A6NHC0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN8A6NHC0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN8A6NHC0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN8A6NHC0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN8A6NHC0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN8A6NHC0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN8A6NHC0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN8A6NHC0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN8A6NHC0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPN8A6NHC0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPN8A6NHC0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPN8A6NHC0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPN8A6NHC0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPN8A6NHC0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPN8A6NHC0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPN8A6NHC0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN8A6NHC0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN8A6NHC0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN8A6NHC0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN8A6NHC0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN8A6NHC0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN8A6NHC0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN8A6NHC0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN8A6NHC0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN8A6NHC0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN8A6NHC0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN8A6NHC0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN8A6NHC0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN8A6NHC0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN8A6NHC0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN8A6NHC0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN8A6NHC0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN8A6NHC0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN8A6NHC0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN8A6NHC0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN8A6NHC0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CAPN8A6NHC0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPN8A6NHC0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPN8A6NHC0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPN8A6NHC0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPN8A6NHC0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPN8A6NHC0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPN8A6NHC0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPN8A6NHC0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPN8A6NHC0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPN8A6NHC0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPN8A6NHC0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPN8A6NHC0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPN8A6NHC0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPN8A6NHC0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPN8A6NHC0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPN8A6NHC0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPN8A6NHC0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPN8A6NHC0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPN8A6NHC0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPN8A6NHC0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPN8A6NHC0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPN8A6NHC0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPN8A6NHC0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPN8A6NHC0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPN8A6NHC0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPN8A6NHC0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPN8A6NHC0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPN8A6NHC0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPN8A6NHC0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPN8A6NHC0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPN8A6NHC0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPN8A6NHC0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPN8A6NHC0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPN8A6NHC0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPN8A6NHC0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPN8A6NHC0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPN8A6NHC0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPN8A6NHC0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPN8A6NHC0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPN8A6NHC0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPN8A6NHC0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPN8A6NHC0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPN8A6NHC0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPN8A6NHC0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPN8A6NHC0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN8A6NHC0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN8A6NHC0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN8A6NHC0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms