Protein–RNA interactions for Protein: A6NFE2

SMCO2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO2A6NFE2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMCO2A6NFE2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMCO2A6NFE2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMCO2A6NFE2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMCO2A6NFE2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMCO2A6NFE2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMCO2A6NFE2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMCO2A6NFE2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SMCO2A6NFE2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SMCO2A6NFE2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SMCO2A6NFE2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SMCO2A6NFE2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMCO2A6NFE2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMCO2A6NFE2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SMCO2A6NFE2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMCO2A6NFE2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMCO2A6NFE2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SMCO2A6NFE2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMCO2A6NFE2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMCO2A6NFE2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMCO2A6NFE2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMCO2A6NFE2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMCO2A6NFE2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMCO2A6NFE2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMCO2A6NFE2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMCO2A6NFE2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMCO2A6NFE2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMCO2A6NFE2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMCO2A6NFE2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMCO2A6NFE2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMCO2A6NFE2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMCO2A6NFE2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMCO2A6NFE2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMCO2A6NFE2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMCO2A6NFE2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMCO2A6NFE2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMCO2A6NFE2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMCO2A6NFE2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMCO2A6NFE2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMCO2A6NFE2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMCO2A6NFE2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMCO2A6NFE2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMCO2A6NFE2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMCO2A6NFE2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMCO2A6NFE2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMCO2A6NFE2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMCO2A6NFE2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMCO2A6NFE2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMCO2A6NFE2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMCO2A6NFE2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMCO2A6NFE2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMCO2A6NFE2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMCO2A6NFE2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMCO2A6NFE2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMCO2A6NFE2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SMCO2A6NFE2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMCO2A6NFE2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMCO2A6NFE2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMCO2A6NFE2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMCO2A6NFE2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMCO2A6NFE2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMCO2A6NFE2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMCO2A6NFE2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMCO2A6NFE2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMCO2A6NFE2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMCO2A6NFE2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMCO2A6NFE2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMCO2A6NFE2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMCO2A6NFE2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMCO2A6NFE2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMCO2A6NFE2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMCO2A6NFE2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMCO2A6NFE2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMCO2A6NFE2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMCO2A6NFE2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMCO2A6NFE2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMCO2A6NFE2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMCO2A6NFE2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMCO2A6NFE2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMCO2A6NFE2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SMCO2A6NFE2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMCO2A6NFE2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMCO2A6NFE2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMCO2A6NFE2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMCO2A6NFE2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMCO2A6NFE2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMCO2A6NFE2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMCO2A6NFE2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMCO2A6NFE2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMCO2A6NFE2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMCO2A6NFE2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMCO2A6NFE2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SMCO2A6NFE2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SMCO2A6NFE2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SMCO2A6NFE2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMCO2A6NFE2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMCO2A6NFE2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMCO2A6NFE2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMCO2A6NFE2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMCO2A6NFE2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms