Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FRMD3A2A2Y4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
FRMD3A2A2Y4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FRMD3A2A2Y4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FRMD3A2A2Y4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FRMD3A2A2Y4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FRMD3A2A2Y4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
FRMD3A2A2Y4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FRMD3A2A2Y4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FRMD3A2A2Y4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FRMD3A2A2Y4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FRMD3A2A2Y4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FRMD3A2A2Y4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FRMD3A2A2Y4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FRMD3A2A2Y4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FRMD3A2A2Y4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
FRMD3A2A2Y4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FRMD3A2A2Y4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FRMD3A2A2Y4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FRMD3A2A2Y4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FRMD3A2A2Y4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FRMD3A2A2Y4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
FRMD3A2A2Y4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
FRMD3A2A2Y4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FRMD3A2A2Y4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FRMD3A2A2Y4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FRMD3A2A2Y4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FRMD3A2A2Y4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FRMD3A2A2Y4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FRMD3A2A2Y4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FRMD3A2A2Y4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FRMD3A2A2Y4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FRMD3A2A2Y4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FRMD3A2A2Y4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FRMD3A2A2Y4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
FRMD3A2A2Y4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FRMD3A2A2Y4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
FRMD3A2A2Y4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FRMD3A2A2Y4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FRMD3A2A2Y4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FRMD3A2A2Y4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FRMD3A2A2Y4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FRMD3A2A2Y4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FRMD3A2A2Y4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FRMD3A2A2Y4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FRMD3A2A2Y4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FRMD3A2A2Y4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FRMD3A2A2Y4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FRMD3A2A2Y4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FRMD3A2A2Y4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FRMD3A2A2Y4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FRMD3A2A2Y4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FRMD3A2A2Y4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FRMD3A2A2Y4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FRMD3A2A2Y4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FRMD3A2A2Y4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FRMD3A2A2Y4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FRMD3A2A2Y4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FRMD3A2A2Y4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FRMD3A2A2Y4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FRMD3A2A2Y4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
FRMD3A2A2Y4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FRMD3A2A2Y4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FRMD3A2A2Y4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FRMD3A2A2Y4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
FRMD3A2A2Y4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FRMD3A2A2Y4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FRMD3A2A2Y4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FRMD3A2A2Y4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FRMD3A2A2Y4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FRMD3A2A2Y4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FRMD3A2A2Y4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FRMD3A2A2Y4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FRMD3A2A2Y4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FRMD3A2A2Y4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FRMD3A2A2Y4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
FRMD3A2A2Y4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
FRMD3A2A2Y4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FRMD3A2A2Y4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FRMD3A2A2Y4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FRMD3A2A2Y4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FRMD3A2A2Y4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FRMD3A2A2Y4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FRMD3A2A2Y4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FRMD3A2A2Y4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FRMD3A2A2Y4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FRMD3A2A2Y4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FRMD3A2A2Y4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FRMD3A2A2Y4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FRMD3A2A2Y4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FRMD3A2A2Y4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FRMD3A2A2Y4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FRMD3A2A2Y4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FRMD3A2A2Y4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FRMD3A2A2Y4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FRMD3A2A2Y4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FRMD3A2A2Y4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FRMD3A2A2Y4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FRMD3A2A2Y4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FRMD3A2A2Y4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms