Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQS6

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQS6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A0U1RQS6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A0U1RQS6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A0U1RQS6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A0U1RQS6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A0U1RQS6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A0U1RQS6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A0U1RQS6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0U1RQS6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0U1RQS6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0U1RQS6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A0U1RQS6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A0U1RQS6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A0U1RQS6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A0U1RQS6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A0U1RQS6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A0U1RQS6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A0U1RQS6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A0U1RQS6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0U1RQS6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0U1RQS6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0U1RQS6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0U1RQS6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0U1RQS6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0U1RQS6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0U1RQS6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
A0A0U1RQS6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A0U1RQS6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A0U1RQS6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A0U1RQS6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A0U1RQS6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A0U1RQS6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A0U1RQS6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A0U1RQS6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A0U1RQS6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A0U1RQS6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A0U1RQS6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A0U1RQS6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A0U1RQS6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A0U1RQS6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A0U1RQS6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A0U1RQS6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A0U1RQS6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A0U1RQS6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A0U1RQS6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A0U1RQS6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A0U1RQS6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A0U1RQS6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A0U1RQS6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A0U1RQS6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A0U1RQS6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A0U1RQS6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A0U1RQS6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A0U1RQS6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A0U1RQS6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A0U1RQS6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A0U1RQS6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A0U1RQS6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A0U1RQS6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A0U1RQS6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A0U1RQS6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A0U1RQS6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A0U1RQS6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A0U1RQS6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A0U1RQS6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A0U1RQS6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A0U1RQS6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A0U1RQS6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
A0A0U1RQS6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
A0A0U1RQS6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
A0A0U1RQS6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
A0A0U1RQS6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
A0A0U1RQS6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
A0A0U1RQS6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
A0A0U1RQS6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
A0A0U1RQS6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0U1RQS6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0U1RQS6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0U1RQS6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0U1RQS6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0U1RQS6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0U1RQS6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0U1RQS6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0U1RQS6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A0U1RQS6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A0U1RQS6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A0U1RQS6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A0U1RQS6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A0U1RQS6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A0U1RQS6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A0U1RQS6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A0U1RQS6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A0U1RQS6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A0U1RQS6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A0U1RQS6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A0U1RQS6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A0U1RQS6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A0U1RQS6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A0U1RQS6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A0U1RQS6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms