Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYH1

C15orf38-AP3S2, Protein C15orf38-AP3S2, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms