Protein–RNA interactions for Protein: A0A096LPK6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A096LPK6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A096LPK6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A096LPK6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A096LPK6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A096LPK6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A096LPK6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A096LPK6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A096LPK6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A096LPK6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A096LPK6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A096LPK6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A096LPK6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A096LPK6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A096LPK6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A096LPK6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A096LPK6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A096LPK6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A096LPK6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A096LPK6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A096LPK6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A096LPK6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A096LPK6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A096LPK6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A096LPK6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A096LPK6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A096LPK6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A096LPK6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A096LPK6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A096LPK6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A096LPK6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A096LPK6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
A0A096LPK6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
A0A096LPK6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A096LPK6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A096LPK6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A096LPK6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A096LPK6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A096LPK6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A096LPK6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A096LPK6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A096LPK6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A096LPK6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A096LPK6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A096LPK6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A096LPK6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A096LPK6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A096LPK6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A096LPK6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A096LPK6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A096LPK6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A096LPK6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A096LPK6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A096LPK6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A096LPK6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A096LPK6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A096LPK6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A096LPK6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A096LPK6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A096LPK6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A096LPK6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A096LPK6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A096LPK6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A096LPK6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A096LPK6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A096LPK6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A096LPK6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A096LPK6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A096LPK6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A096LPK6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A096LPK6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A096LPK6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A096LPK6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A096LPK6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A096LPK6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A096LPK6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A096LPK6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A096LPK6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A096LPK6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A096LPK6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A096LPK6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A096LPK6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A096LPK6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A096LPK6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A096LPK6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
A0A096LPK6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
A0A096LPK6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
A0A096LPK6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A096LPK6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A096LPK6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A096LPK6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A096LPK6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A096LPK6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A096LPK6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A096LPK6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A096LPK6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A096LPK6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A096LPK6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A096LPK6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A096LPK6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A096LPK6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms