Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WWV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WWV3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
A0A087WWV3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
A0A087WWV3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
A0A087WWV3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
A0A087WWV3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
A0A087WWV3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
A0A087WWV3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
A0A087WWV3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
A0A087WWV3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
A0A087WWV3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
A0A087WWV3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
A0A087WWV3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
A0A087WWV3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
A0A087WWV3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
A0A087WWV3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
A0A087WWV3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
A0A087WWV3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
A0A087WWV3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
A0A087WWV3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
A0A087WWV3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
A0A087WWV3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
A0A087WWV3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
A0A087WWV3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
A0A087WWV3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
A0A087WWV3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
A0A087WWV3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
A0A087WWV3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
A0A087WWV3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
A0A087WWV3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A087WWV3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A087WWV3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A087WWV3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A087WWV3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A087WWV3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A087WWV3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A087WWV3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A087WWV3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A087WWV3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A087WWV3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A087WWV3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A087WWV3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
A0A087WWV3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
A0A087WWV3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
A0A087WWV3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
A0A087WWV3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
A0A087WWV3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
A0A087WWV3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
A0A087WWV3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
A0A087WWV3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
A0A087WWV3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
A0A087WWV3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
A0A087WWV3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
A0A087WWV3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
A0A087WWV3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
A0A087WWV3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
A0A087WWV3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
A0A087WWV3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
A0A087WWV3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
A0A087WWV3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
A0A087WWV3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
A0A087WWV3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
A0A087WWV3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
A0A087WWV3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
A0A087WWV3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
A0A087WWV3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
A0A087WWV3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
A0A087WWV3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
A0A087WWV3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
A0A087WWV3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
A0A087WWV3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
A0A087WWV3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
A0A087WWV3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
A0A087WWV3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
A0A087WWV3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
A0A087WWV3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
A0A087WWV3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
A0A087WWV3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
A0A087WWV3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
A0A087WWV3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
A0A087WWV3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
A0A087WWV3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
A0A087WWV3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
A0A087WWV3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
A0A087WWV3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
A0A087WWV3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
A0A087WWV3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
A0A087WWV3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
A0A087WWV3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
A0A087WWV3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
A0A087WWV3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
A0A087WWV3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
A0A087WWV3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
A0A087WWV3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
A0A087WWV3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
A0A087WWV3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
A0A087WWV3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
A0A087WWV3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
A0A087WWV3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
A0A087WWV3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
A0A087WWV3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms