Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms