Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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KCNIP3Q9Y2W7 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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KCNIP3Q9Y2W7 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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