Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms