Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms