Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP8AP2Q9UKL3 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms