Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV3

MID2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID2Q9UJV3 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MID2Q9UJV3 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MID2Q9UJV3 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MID2Q9UJV3 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MID2Q9UJV3 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms